查找与查询序列匹配的生物序列，可直接输入蛋白/核苷酸序列或导入 .txt/.fasta 格式文件进行序列检索。
1. 输入或复制粘贴蛋白/核苷酸序列，或上传序列文件：
- 单一序列：.txt文件
- 多条序列:.fasta 文件
注： 最多可导入100条序列。
2. 根据被输入的序列类型选择Sequence Type 。
3.选择相关的Search Within选项。 勾选 Include NCBI Sequences 的复选框，在检索结果中包含NCBI数据库中的序列。
4. 点击Start Biosequence Search 开始序列检索。
点击 Advanced Biosequence Search 设置参数，如序列一致性百分比、空位罚分和 BLAST 算法等。
然后返回到主页面，查看每个检索的完成状态或点击 View Results 查看结果。
重要提示：生物序列检索结果在首次生成之日起 30 天后到期。
Advanced Sequence Search
高级序列检索（Advanced Sequence Search）包含基于所选序列类型和检索范围选项的默认值。
|
Sequence Type / Search Within |
Options (Default Value Shown) |
||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Adjust Parameters for Short Sequences |
Sequence Identity % |
Match with Gaps |
Gap Costs |
Query Coverage % |
Word Size |
Reward for Match, Penalty for Mismatch |
Scoring Matrix |
BLAST Algorithm |
E-Value |
Exclude Low-Complexity Regions |
|
|
Nucleotide / Nucleotides |
Available |
80 |
No |
Existence 5, Extension 2 |
90 |
11 |
2, -3 |
— |
BLASTn |
10 |
No |
|
Nucleotide / Proteins |
N/A |
— |
No |
Existence 11, Extension 1 |
90 |
6 |
— |
BLOSUM62 |
BLASTx-fast |
10 |
— |
|
Protein / Nucleotides |
N/A |
— |
No |
Existence 11, Extension 1 |
90 |
6 |
— |
BLOSUM62 |
TBLASTn-fast |
10 |
— |
|
Protein / Proteins |
Available |
— |
No |
Existence 11, Extension 1 |
90 |
3 |
— |
BLOSUM62 |
BLASTp |
10 |
No |