用于逆合成反应路线设计的参数

  • Updated
Download Icon Download

逆合成反应路线设计的默认参数包括:

要应用以下选项生成逆合成反应路线,请点击 Create Retrosynthesis Plan 。

_SFn-Retrosyn-PlanOptions.png

 

合成深度

合成深度用于限制逆合成设计中允许的合成步数,最长路径设置最多四步。当达到起始原料成本或合成深度限制时,逆合成分析就终止。所有的逆合成反应路线都将会呈现(无论是终止于起始原料成本还是合成深度限制)。设置较高的参数值会增加在所有路径中找到到达起始原料的合成路径的可能性,但检索时间也会更长。

默认的合成深度是三步,因为它平衡了实际的合成需求和计算成本。

_SFn-Retrosynthesis-PlanOptionsPage-SetSyntheticDepth.png

注意:有些逆合成路线设计的合成深度可能大于指定的深度;这是因为中间体的结构可能存在于其他逆合成路线或检索路线(search trees)中。因此,之前发现的逆合成路线将被重复使用,有时还会扩展。

 

键断裂和键保护

设置键断裂是一种有用的方法,用于提交更具体的逆合成设计检索式,以精简建议的路径并指导检索和控制解决方案的复杂程度。可以在目标分子中设置一个键的断裂或保护多个键。

要设置某个键断裂:

  1. 点击Break Bond
  1. 点击结构中需要断裂的键。被选定断裂的键用绿色高亮显示。

_SFn-Retrosynthesis-PlanOptionsPage-BreakBond.png
注:如果想选择不同的键,请点击Clear All bond Selections链接或点击结构中高亮显示的键来取消当前的选择。

设置键保护:

  1. 点击Protect Bond
  1. 点击结构中需要保护的键。受保护的键以红色高亮显示。

_SFn-Retrosynthesis-PlanOptionsPage-ProtectBond.png提示 :

  • 要清除所有选择,请点击Clear All Bond Selections链接。
  • 要清除单个选择,点击结构中高亮显示的键。

重要提示 : 在逆合成分析过程中,受保护的键不会被完全破坏,但键序可能会发生变化。

 

支持预测反应的规则

根据支持的文献实例数量触发反应规则:

  • Common规则包括实验室中常用的反应类型。它们被认为既稳定又通用,并得到许多文献实例的支持
  • UncommonRare规则被较少的实例支持,但可能会披露出更多新的合成方法

注: 选择Uncommon 或 Rare 规则,检索速度可能会降低

_SFn-Retrosynthesis-PlanOptionsPage-RulesSupporting.png

 

起始原料成本限制

对于逆合成设计路线中的每一步,逆合成检索都将前体与商业上可获得的化合物进行比较。当逆合成路线达到起始原料的成本限制或合成深度限制时,路线设计就终止。默认的原料成本限制是1000美元/mol或 or 10 美元/g。

注:起始原料成本限制将被保留,用于进一步的路线设计。

_SFn-Retrosynthesis-PlanOptionsPage-StartingMaterialsCostLimit.png